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そんなある日、ヘリオポリスに[[ザフト軍]]の特務部隊が襲来。偶然居合わせていた少女[[カガリ・ユラ・アスハ]]とともにシェルターへ避難しようとする途中で、偶然にも[[地球連合軍]]の最新鋭機[[ストライクガンダム|ストライク]]を発見してしまう。満員寸前のシェルターにカガリを一人で避難させると自身は別のシェルターへ向かおうとしたが、ストライクの護衛についていた技術士官[[マリュー・ラミアス]]から既に別のシェルターは破壊されている事を聞かされ、やむなくマリューとともにストライクに同乗することとなる。ストライクへと乗り込もうとした寸前に、幼少期に別れザフトに入隊していたキラの親友、[[アスラン・ザラ]]と再会するが、この時は工廠が崩れかけていたためお互いに会話する余裕はなかった。

そんなある日、ヘリオポリスに[[ザフト軍]]の特務部隊が襲来。偶然居合わせていた少女[[カガリ・ユラ・アスハ]]とともにシェルターへ避難しようとする途中で、偶然にも[[地球連合軍]]の最新鋭機[[ストライクガンダム|ストライク]]を発見してしまう。満員寸前のシェルターにカガリを一人で避難させると自身は別のシェルターへ向かおうとしたが、ストライクの護衛についていた技術士官[[マリュー・ラミアス]]から既に別のシェルターは破壊されている事を聞かされ、やむなくマリューとともにストライクに同乗することとなる。ストライクへと乗り込もうとした寸前に、幼少期に別れザフトに入隊していたキラの親友、[[アスラン・ザラ]]と再会するが、この時は工廠が崩れかけていたためお互いに会話する余裕はなかった。

炎上する工廠から辛くも脱出した直後、[[ミゲル・アイマン]]の操縦するジンに発見され窮地に陥る。未完成のOSを見たキラはこのままではじきに撃墜されると感じマリューと操縦を交代、一瞬のうちにストライクのOSを最適な状態に書き換え、なんとかジンを撃退する。しかし軍の最重要機密であるストライクを見てしまったこと、さらに機体のOSをナチュラルには扱えない物に書き換えてしまったことから、やむなく友人たちとともに地球軍の戦艦[[アークエンジェル]]に乗艦、ストライクのパイロットとして戦火に身を投じることとなった。

炎上する工廠から辛くも脱出した直後、[[ミゲル・アイマン]]の操縦するジンに発見され窮地に陥る。未完成のOSを見たキラはこのままではじきに撃墜されると感じマリューと操縦を交代、一瞬のうちにストライクのOSを最適な状態に書き換え、なんとかジンを撃退する。しかし軍の最重要機密であるストライクを見てしまったこと、機体のOSをナチュラルには扱えない物に書き換えてしまったこと、さらに戦闘の影響でヘリオポリスが崩壊したことから、やむなく友人たちとともに地球軍の戦艦[[アークエンジェル]]に乗艦、ストライクのパイロットとして戦火に身を投じることとなった。

戦場でふたたびアスランと再会したキラは、アスランから再三にわたってザフト、プラントに来るように説得される。アスランとは戦いたくないとしつつも、ヘリオポリスで共に過ごした友人らを見捨てることができなかったため、これを拒絶した。アークエンジェルが窮地に陥った際には初めて[[S.E.E.D.]]を発現している。

戦場でふたたびアスランと再会したキラは、アスランから再三にわたってザフト、プラントに来るように説得される。アスランとは戦いたくないとしつつも、ヘリオポリスで共に過ごした友人らを見捨てることができなかったため、これを拒絶した。アークエンジェルが窮地に陥った際には初めて[[S.E.E.D.]]を発現している。